龍が如く 維新! 極におけるすべてのサブストーリーの発生時期や場所のまとめ。
時間限定の要素はないため、プレイヤーが好きなタイミングで回収することができます。すべてのサブストーリーを完了することで下記のトロフィー・実績が解除される。
 | サブストーリー１０ |
| １０個以上のサブストーリーをクリアした |
 | サブストーリー４０ |
| ４０個以上のサブストーリーをクリアした |
 | サブストーリー制覇！ |
| 全てのサブストーリーをクリアした |
PS4のセーフをPS5に移行する場合、達成条件をぴったりしないとトロフィーは解除されないためサブストーリー9個、39個、71個をクリアしたセーフを用意する必要はある。
- 伏見
- 洛外
- 洛内
- 壬生
- 祇園
- 骸街
| # | タイトル | 発生時期 | 町 | 場所 | 備考 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蝶のように舞う男 | 3章 | 洛内 | 河原町 | |
| 2 | 神様 仏様 恵比寿様 | 3章 | 洛内 | 烏丸通 | |
| 3 | 芸術的接待 | 3章 | 洛外 | 山王町 | [1]クリア後、カラオケを一回クリア 豪快に表現された男らしさ 大胆な中に見え隠れする優雅さ |
| 4 | 引っ越すあの娘 | 3章 | 洛内 | 河原町 | 友達になってくれてありがとう 大切な存在だからこそ言えなかった |
| 5 | 土佐弁講座 | 3章 | 洛内 | 河原町 | 1回目 お久しぶり 私 あなた 2回目 いつもしているんですか？ 苦しい 早く 3回目 つまづくことがあっても 意気地のない人 すぐに言って |
| 6 | 五の中の二の嘘 | 3章 | 洛内 | 神明町 | 東原と南野 |
| 7 | 苦しみを踊りにのせて | 3章 | 洛内 | 烏丸通南 | |
| 8 | 飛脚代理 | 5章 | 洛内 | 四条大橋 | |
| 9 | 黒豹飛脚団、登場 | 5章 | 洛内 | 四条大橋 | [8]クリア後 |
| 10 | 黒豹の千両役者 | 5章 | 洛内 | 寺町通り | [9]クリア後 |
| 11 | 世界を知る男 | 3章 | 洛内 | 寺町 | 日本 清国 4の国 |
| 12 | はらぺこ力士 | 5章 | 洛内 | 寺町通南 | |
| 13 | 愛に飢えた男 | 4章 | 洛内 | 寺町 | |
| 14 | そそっかしい奥さん | 4章 | 洛内 | 烏丸通 | |
| 15 | 怪我したおばあちゃん | 3章 | 洛内 | 寺町 | |
| 16 | 吠え続ける犬 | 4章 | 洛内 | 寺町 | |
| 17 | 招き猫 | 4章 | 洛内 | 烏丸通 | |
| 18 | 引きこもり | 3章 | 洛外 | 梅小路町東 | いつも何をしているんだ？ まずは何気ない会話で打ち解ける 自信をつけさせる |
| 19 | 籠の中の乙女 | 6章 | 洛外 | 梅小路町 | |
| 20 | 武士いんたびゅう | 7章 | 洛外 | 梅小路町東 | |
| 21 | 尊王攘夷 | 3章 | 洛外 | 梅小路町北 | |
| 22 | よくないじゃないか | 3章 | 洛外 | 梅小路町東 | |
| 23 | 命知らずの恩返し | 6章 | 洛外 | 山王町 | |
| 24 | 黒豹の司令塔 | 5章 | 別宅 | – | [10]クリア後 別宅に戻って家に入る |
| 25 | 刀に魅せられた男 | 3章 | 洛外 | 山王町 | |
| 26 | 正義感ある怪我人 | 5章 | 洛外 | 梅小路町南 | |
| 27 | 謎の商人 | 4章 | 洛外 | 梅小路町西 | |
| 28 | はらぺこな猫 | 4章 | 洛外 | 梅小路町東 | |
| 29 | 物騒な町 | 3章 | 骸街 | 骸街一階 | |
| 30 | 喧嘩屋・墨坊主 | 3章 | 骸街 | 骸街一階 | [7]クリア後 |
| 31 | 増えた入れ墨 | 6章 | 骸街 | 骸街一階 | [30]クリア後 |
| 32 | 悟りを開いた男 | 10章 | 骸街 | 骸街一階 | [31]クリア後 |
| 33 | 亡霊武者 | 7章 | 骸街 | 骸街一階 | |
| 34 | 卑屈な物乞い | 3章 | 骸街 | 骸街一階 | |
| 35 | ごみを集める男 | 4章 | 骸街 | 骸街一階 | |
| 36 | 傷ついた犬 | 4章 | 骸街 | 骸街一階 | |
| 37 | 文豪の葛藤 | 2章 | 伏見 | 寺田屋2階 | 猫がいいんじゃないか 僕ちゃん 気持ち |
| 38 | 入れ替わった手荷物 | 8章 | 伏見 | 蔵町 | [71]クリア後 |
| 39 | いい汗をかく男 | 3章 | 伏見 | 屋敷町 | |
| 40 | おいなりさん | 3章 | 伏見 | 屋敷町 | |
| 41 | 大事なのはやっぱりコシ | 2章 | 伏見 | 伏見一番街 | 2回目の食事で発生 |
| 42 | 黒船？ 襲来 | 7章 | 伏見 | 伏見一番街南 | |
| 43 | 長々とした話 | 2章 | 伏見 | 屋敷町南 | タケノコ 茶屋の前 咲子 |
| 44 | 長々とした話、おかわり | 2章 | 伏見 | 屋敷町南 | [43]クリア後 赤・白・緑 甘酒 すみれ |
| 45 | これが最後の長話 | 2章 | 伏見 | 屋敷町南 | [44]クリア後 かかし 大根の浅漬け カツオ |
| 46 | 香水 | 3章 | 伏見 | 新町 | |
| 47 | ええじゃないか | 2章 | 伏見 | 屋敷町北 | |
| 48 | サムライの定義 | 6章 | 伏見 | 屋敷町 | |
| 49 | 決着！黒豹飛脚団 | 5章 | 伏見 | 新町 | [24]クリア後 |
| 50 | 崖っぷち釣り人 | 2章 | 伏見 | 新町 | |
| 51 | がらくた少年 | 2章 | 伏見 | 蔵町 | |
| 52 | 薪割り爺さん | 2章 | 伏見 | 屋敷町南 | |
| 53 | 方向音痴の飛脚 | 3章 | 伏見 | 新町 | |
| 54 | 待ち続ける犬 | 4章 | 伏見 | 屋敷町 | |
| 55 | 汚れた猫 | 4章 | 伏見 | 屋敷町南 | |
| 56 | まだ見ぬ君へ | 4章 | 祇園 | – | |
| 57 | 吸い付きそうな肌の持ち主 | 3章 | 祇園 | – | 払わない |
| 58 | 革命料理人 | 4章 | 祇園 | – | |
| 59 | 妖艶な奥様 | 4章 | 祇園 | – | |
| 60 | 醜いもの、美しいもの | 5章 | 壬生 | – | |
| 61 | 花は枯れて また咲く | 4章 | 壬生 | – | 別宅のさくらの樹 |
| 62 | 大御所の料理人 | 5章 | 別宅 | – | 料理を10回作成することで開始 |
| 63 | くまがでた！ | 5章 | 壬生 | – | [60]クリア後 |
| 64 | 龍馬はお母さん | 4章 | 壬生 | – | [61]クリア後 |
| 65 | 思い出せない男 | 4章 | – | – | 清水寺への道にある |
| 66 | 野菜好き少年 | 4章 | 壬生 | – | |
| 67 | その女、破天荒につき | 4章 | 洛外 | 梅小路町 | [69]クリア後 |
| 68 | 鉄の女 | 4章 | 洛外 | 梅小路町 | [67]クリア後 |
| 69 | 正義の借金取り | 4章 | 洛外 | 梅小路町 | |
| 70 | 酒気を帯びた異人 | 5章 | 伏見 | 伏見一番街 | |
| 71 | 狙われた友人 | 7章 | 伏見 | 伏見一番街 | [70]クリア後かつ サトウに手記を20個渡しした |
| 72 | ゆずれない想い | 14章 | 伏見 | 伏見一番街 | [71]クリア後 サトウに手記を25個渡す |